Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TrabdQ99JY4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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TrabdQ99JY4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TrabdQ99JY4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TrabdQ99JY4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms