Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tlcd1Q99JT6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlcd1Q99JT6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms