Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Slc8b1Q925Q3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Slc8b1Q925Q3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Slc8b1Q925Q3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc8b1Q925Q3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Slc8b1Q925Q3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Slc8b1Q925Q3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Slc8b1Q925Q3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Slc8b1Q925Q3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Slc8b1Q925Q3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Slc8b1Q925Q3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Slc8b1Q925Q3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Slc8b1Q925Q3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Slc8b1Q925Q3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc8b1Q925Q3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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