Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trim7Q923T7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim7Q923T7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms