Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf3Q922U1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prpf3Q922U1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms