Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx18Q91ZR2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx18Q91ZR2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms