Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Pde6cQ91ZQ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pde6cQ91ZQ1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Pde6cQ91ZQ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Pde6cQ91ZQ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Pde6cQ91ZQ1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Pde6cQ91ZQ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pde6cQ91ZQ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Pde6cQ91ZQ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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