Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Snx4Q91YJ2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx4Q91YJ2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms