Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm2Q91YD4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm2Q91YD4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm2Q91YD4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms