Protein–RNA interactions for Protein: Q91XS1

Mtmr4, Myotubularin-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr4Q91XS1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr4Q91XS1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr4Q91XS1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr4Q91XS1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr4Q91XS1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr4Q91XS1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr4Q91XS1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr4Q91XS1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mtmr4Q91XS1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mtmr4Q91XS1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr4Q91XS1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms