Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Capn8Q91VA3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Capn8Q91VA3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms