Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ApofQ91V80 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ApofQ91V80 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms