Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H1fooQ8VIK3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H1fooQ8VIK3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms