Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Odf4Q8VI88 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Odf4Q8VI88 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms