Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crb1Q8VHS2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crb1Q8VHS2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Crb1Q8VHS2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms