Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppargc1bQ8VHJ7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms