Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fyco1Q8VDC1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Fyco1Q8VDC1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fyco1Q8VDC1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms