Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Ubxn4Q8VCH8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ubxn4Q8VCH8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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