Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rdh10Q8VCH7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rdh10Q8VCH7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rdh10Q8VCH7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rdh10Q8VCH7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Rdh10Q8VCH7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rdh10Q8VCH7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rdh10Q8VCH7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Rdh10Q8VCH7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rdh10Q8VCH7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Rdh10Q8VCH7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rdh10Q8VCH7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Rdh10Q8VCH7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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