Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q8VCE4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8VCE4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VCE4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms