Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc58Q8R3Q6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms