Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dnaaf4Q8R368 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dnaaf4Q8R368 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms