Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Hecw1Q8K4P8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Hecw1Q8K4P8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Hecw1Q8K4P8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms