Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pof1bQ8K4L4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pof1bQ8K4L4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms