Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
OptnQ8K3K8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
OptnQ8K3K8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
OptnQ8K3K8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms