Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk5rap2Q8K389 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdk5rap2Q8K389 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk5rap2Q8K389 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms