Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lrrtm1Q8K377 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrtm1Q8K377 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms