Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Prpf39Q8K2Z2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Prpf39Q8K2Z2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms