Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc12Q8K2L8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trappc12Q8K2L8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc12Q8K2L8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms