Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Depp1Q8K2F3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Depp1Q8K2F3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms