Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mtmr3Q8K296 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mtmr3Q8K296 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms