Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Neil3Q8K203 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Neil3Q8K203 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms