Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Polr1eQ8K202 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Polr1eQ8K202 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms