Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nek9Q8K1R7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nek9Q8K1R7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms