Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sde2Q8K1J5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sde2Q8K1J5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sde2Q8K1J5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms