Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700001C19RikQ8K168 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700001C19RikQ8K168 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700001C19RikQ8K168 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700001C19RikQ8K168 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms