Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc47a1Q8K0H1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc47a1Q8K0H1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms