Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NgefQ8CHT1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NgefQ8CHT1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NgefQ8CHT1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NgefQ8CHT1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 991.1 ms