Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
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