Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGQ8

Slc24a4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a4Q8CGQ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc24a4Q8CGQ8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc24a4Q8CGQ8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc24a4Q8CGQ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc24a4Q8CGQ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc24a4Q8CGQ8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc24a4Q8CGQ8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc24a4Q8CGQ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc24a4Q8CGQ8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc24a4Q8CGQ8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc24a4Q8CGQ8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms