Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Usp27Q8CEG8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Usp27Q8CEG8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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Usp27Q8CEG8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Usp27Q8CEG8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Usp27Q8CEG8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Usp27Q8CEG8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Usp27Q8CEG8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Usp27Q8CEG8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Usp27Q8CEG8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Usp27Q8CEG8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Usp27Q8CEG8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Usp27Q8CEG8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Usp27Q8CEG8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms