Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RybpQ8CCI5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RybpQ8CCI5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms