Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Nhlrc3Q8CCH2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nhlrc3Q8CCH2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Nhlrc3Q8CCH2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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