Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc142Q8CAI1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Ccdc142Q8CAI1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc142Q8CAI1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc142Q8CAI1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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