Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nhsl1Q8CAF4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nhsl1Q8CAF4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nhsl1Q8CAF4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nhsl1Q8CAF4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nhsl1Q8CAF4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nhsl1Q8CAF4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nhsl1Q8CAF4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nhsl1Q8CAF4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nhsl1Q8CAF4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nhsl1Q8CAF4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nhsl1Q8CAF4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms