Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vwc2Q8C8N3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vwc2Q8C8N3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms