Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apoa5Q8C7G5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa5Q8C7G5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms