Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bhlhe22Q8C6A8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhe22Q8C6A8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms