Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc113Q8C5T8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Ccdc113Q8C5T8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Ccdc113Q8C5T8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ccdc113Q8C5T8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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Ccdc113Q8C5T8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc113Q8C5T8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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