Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Strip1Q8C079 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Strip1Q8C079 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms